Gunnar Flagstad har sin utdannelse fra Østlandets musikkonservatorium og Norges musikkhøgskole, hvor han avsluttet «hovedfag akkompagnement/samspill» våren -97 med høyeste karakter. Han er i dag førsteamanuensis i akkompagnement ved Norges musikkhøgskole og Barratt Due musikkinstitutt.
Flagstad har opptrådt på arenaer som Festspillene i Bergen, Oslo kammermusikkfestival, Hardanger Musikkfest, Kirsten Flagstadfestivalen, Vinterspillene på Lillehammer og NRK radio og TV. Han turnerer regelmessig med Rikskonsertene over hele landet, og har også konsertert i europeiske land som England, Tyskland, Polen, Latvia og Hviterussland. Av musikere han har samarbeidet med kan nevnes Dora Schwarzberg, Piotr Janowski, Henning Kraggerud, Oleg Kogan, Tine Thing Helseth, Alexander Rybak, Solveig Kringlebotn og Elizabeth Norberg-Schulz.
